Código de barras de ADN de los peces marinos comerciales del Perú

Abstract

La investigación fue llevada a cabo entre marzo de 2017 y diciembre de 2019, tuvo como objetivo aplicar el método de identificación molecular utilizando el Código de Barras de ADN para determinar las especies de peces comerciales desembarcados en el litoral peruano. Se colectaron un total de 722 peces marinos de diferentes zonas biogeográficas: Norte Tropical, Norte, Centro y Sur del litoral peruano. A partir de muestras de músculo de estos peces, se generaron 722 códigos de ADN utilizando un fragmento de 654 pb del gen de la subunidad I del citocromo C oxidasa mitocondrial (COI). Las especies identificadas abarcan 142 morfoespecies pertenecientes a 144 géneros, 55 familias y 29 órdenes de la clase Actinopterygii. Cada especie se asoció con un código de barras de ADN. Se logró obtener códigos BIN únicos para taxones como Hysoblennius, Stellifer, Seriola peruana y Emblemaria hudsoni, representando los primeros registros de estas especies en las bases de datos BOLD y GenBank. La validación de la identificación molecular se realizó al combinar los códigos de barras COI con secuencias de referencia de las especies confirmadas mediante identificación morfológica. Se observó un aumento en los valores de distancia genética utilizando los parámetros de Kimura 2 a medida que se ascendía en la jerarquía taxonómica. Los árboles de unión de vecinos se construyeron usando los códigos de barras del ADN, permitiendo agrupar los especímenes según su clasificación taxonómica a nivel de especie. Se reportan potenciales nuevas especies Psenes sp (LCT 1199), Umbrina sp (Pe Mar F0460), Stellifer sp (Pe Mar F0566, F0567 y F0601), Myctophum sp (Pe Mar F0149) y P. adspersus (Pe Mar F843). Estos resultados corroboran la eficacia del código de barras de ADN como herramienta molecular precisa para la identificación de especies de peces, contribuyendo a una mejora significativa en la identificación taxonómica.

Abstract: The research was carried out between March 2017 and December 2019, with the aim of applying the molecular identification method using DNA Barcoding to determine the species of commercial fishes landed on the Peruvian coast. A total of 722 marine fishes were collected from different biogeographical zones: Tropical North, North, Central, and South of the Peruvian coast. From muscle samples of these fishes, 722 DNA barcodes were generated using a 654-base pair fragment of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene. These identified species encompass 142 morphospecies belonging to 144 genera, 55 families, and 29 orders of the class Actinopterygii. Each species was associated with a unique DNA barcode. Unique BIN codes were successfully obtained for taxa such as Hysoblennius, Stellifer, Seriola peruana, and Emblemaria hudsoni, representing the first records of these species in the BOLD and GenBank databases. Validation of molecular identification was performed by combining COI barcode sequences with reference sequences of species confirmed through morphological identification. An increase in genetic distance values using Kimura 2 parameters was observed as one ascended in the taxonomic hierarchy. Neighbor-joining trees were constructed using DNA barcodes, allowing the grouping of specimens based on their taxonomic classification at the species level. Potential new species are reported: Psenes sp (LCT 1199), Umbrina sp (Pe Mar F0460), Stellifer sp (Pe Mar F0566, F0567, and F0601), Myctophum sp (Pe Mar F0149), and P. adspersus (Pe Mar F843). These results confirm the efficacy of using DNA barcoding as a precise molecular tool for fish species identification, significantly enhancing taxonomic identification.